بر اساس دستور رهبر معظم انقلاب اسلامی حضرت آیتالله خامنهای مدظلهالعالی مبنی بر تجدید نظر در اساسنامه شورای نمایندگان و دفاتر آنها دردانشگاهها (موضوع مصوبه شماره .1368دش مورخ 69.4.28 شورای عالی انقلاب فرهنگی و اصلاحیههای آن) و ایجاد سازمان جدیدی برای تحققاهداف مورد نظر معظمله "نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری در دانشگاهها" با این اهداف، وظایف و سازمان تشکیل میشود:
ماده 1 - نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری در دانشگاهها که در این اساسنامه اختصاراً "نهاد نمایندگی" نامیده میشود نهادی است که زیر نظر معظمله درکلیه دانشگاهها و مراکز آموزش عالی به انجام وظایف مصرح در اساسنامه میپردازد.
ماده 2 - اهداف:
1 - توسعه و تعمیق آگاهیها و علایق اسلامی دانشجویان و دانشگاهیان و تبیین ارزشهای اسلامی.
2 - ایجاد و گسترش فضای معنوی و اسلامی در دانشگاهها و رشد فضایل اخلاقی در دانشگاهیان
3 - رشد بینش سیاسی در محیط دانشگاه
4 - حمایت و هدایت فکری تشکلهای دانشجویی و دانشگاهی
5 - حاکمیت بخشیدن به ارزشهای اسلامی و انقلابی در سطوح اجرایی و علمی
6 - مقابله با ترویج عقاید و افکار انحرافی و هجوم فرهنگی و تقویت روح خودباوری و استقلال فکری
7 - تقویت پیوند حوزه و دانشگاه
ماده 3 - وظایف:
1 - تبیین مسایل سیاسی، اجتماعی و فرهنگی از طریق برگزاری جلسات، سخنرانی و بحث و مناظره، نشر مقالات و جزوات و مانند آن.
2 - انجام دادن مسئولیتهای روحانیت در محیط دانشگاه مانند اقامه جماعت و بر پایی مجالس و محافل
مذهبی و اهتمام به تعظیم شعایر اسلامی ومراسم دینی
3 - اجرای برنامههای آموزشی، پژوهشی و تربیتی در زمینه علوم و معارف اسلامی از قبیل: برگزاری گردهماییها و نشستهای تخصصی، جلسات پاسخ به سئوالات، نشر مقالات و جزوات و فعالیتهای فوق برنامه و مانند آن.
4 - حضور فعال در میان دانشجویان و دانشگاهیان به منظور راهنمایی و ارشاد فکری و اخلاقی و پاسخگویی به مسائل شرعی.
5 - هدایت تشکلها و نهادها و حرکتهای اسلامی دانشجویی و دانشگاهی و تقویت فعالیتها ی اسلامی در دانشگاه.
6 - مطالعه و بررسی وضع دینی و اعتقادی و گرایشهای فرهنگی و سیاسی در محیط دانشگاه و علل ضعفها و نارساییها برای دستیابی به راه حلهایمناسب.
7 - بسط فرهنگ امر به معروف و نهی از منکر و اقامه نماز در دانشگاهها.
8 - همکاری با نهادها و مراکز حوزهای و دانشگاهی و پشتیبانی از آنها برای تقویت پیوند حوزه و دانشگاه.
9 - گزینش علمی و عمومی استادان دروس معارف اسلامی و نظارت بر کیفیت ارائه آن دروس و ارزیابی عملکرد آنان.
10 - تأیید رییس پیشنهادی گروه معارف اسلامی قبل از معرفی به رییس دانشگاه.
11 - نظارت بر رعایت موازین اسلامی و ارزشهای انقلاب در امور اداره دانشگاهها، تشکلها و فعالیتهای فرهنگی و سیاسی - اجتماعی مراکز هنری و ورزشی و خوابگاههای دانشگاهی و نیز نشریات داخلی دانشگاه
12 - بررسی مقررات، آییننامهها و بخشنامههای راجع به امور فرهنگی در مراکز آموزش عالی و مؤسسات وابسته از نظر انطباق با معیارها وارزشهایاسلامی و انقلاب اسلامی.
13 - حمایت از نیروهای متخصص و متعهد در دانشگاه.
14 - اعلام نظر کتبی درباره خلافهای بین متون جزوات درسی و مباحث راجع به مبانی ارزشها و دیدگاههای دینی و اسلامی از طرف دفتر مرکزی نهاد،به مسئولان ذیربط برای اصلاح.